對水冷式冷凍機故障的處理必須嚴格遵循科學的程序辦事，冷凍機操作員不可在情況不清、故障不明、心中無數時就擅自行動，隨意拆卸水冷式冷凍機。這樣做的后果不僅沒有找出故障原因，往往會使水冷式冷凍機已經發生的故障擴大化，或者引起新的故障，甚至會對水冷式冷凍機造成嚴重損害。
　　
　　如果用戶正在運行中的水冷式冷凍機突然出現故障，首先應該對水冷式冷凍機進行關機處理，然后細致認真的對冷凍機進行現場檢查，了解水冷式冷凍機在故障發生時各個部件的工作狀況，確定是水冷式冷凍機的哪個部位發生故障，以及它的損壞程度是怎樣。
　　
　　在確定水冷式冷凍機故障發生的經過并對其采取緊急措施后，水冷式冷凍機操作員應該及時與水冷式冷凍機的廠家取得聯系，詳細說明故障發生的部位及故障狀況。由工廠安排維修技術員到達現場后，才能對雖然有故障，但還可以在短時間內運轉并不會使故障進一步惡化的水冷式冷凍機或者輔助裝置親自進行啟動操作，為正確分析故障原因掌握準確的感性認識依據。
　　
　　另外，維修技術員可以通過檢查水冷式冷凍機的運行記錄表來分析故障發生的原因。特別是要重視記錄表中不同常態的運行數據和發生過的問題，以及更換或維修過的零件的運轉時間和可靠性，了解因為任何原因引起過的安全保護停機等情況，這些與故障發生有著密切的關系，尤其不能忽視。
　　
　　如果用戶要確保水冷式冷凍機能夠24小時正常、安全、穩定的長期運行，在條件允許的情況下，建議可以多配置一臺水冷式冷凍機作為備用，即使其中的一臺水冷式冷凍機因為長時間運轉導致不可避免的故障發生，還可以啟動備用的水冷式冷凍機進行工作，不會影響用戶對制冷的需求。
　　
　　較后，也是較重要的一點，希望用戶能夠重視起來：一定要對水冷式冷凍機進行定期的清洗、維護保養工作。畢竟不管是哪一種機器設備，長時間的聯軸運轉或摩擦肯定會磨損設備的各個組件，運行的時間越長，故障發生的次數及組件也就越多，使用壽命勢必會大打折扣。定期對冷凍機做好維護保養工作，等于是花較少的錢，在非常大程度上保證冷水機長期使用。